Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms