Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPM3Q9HCF6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms