Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms