Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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