Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BBS2Q9BXC9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms