Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms