Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOXF2Q9BQY4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms