Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms