Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms