Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ATF6BQ99941 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms