Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms