Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms