Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms