Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms