Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS1Q96KK3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms