Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAGED4Q96JG8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms