Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3S1Q92572 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms