Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms