Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L2Q8NHZ7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms