Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms