Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP2Q86UW6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms