Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms