Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms