Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf139Q6ZV77 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf139Q6ZV77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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