Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms