Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN1Q6UXK5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN1Q6UXK5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms