Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms