Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms