Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CEP135Q66GS9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP135Q66GS9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms