Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBAP2Q5T6F2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBAP2Q5T6F2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms