Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms