Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEXMIFQ5QGS0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms