Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A3Q5K4L6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms