Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITRM1Q5JRX3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms