Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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