Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms