Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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