Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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