Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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