Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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