Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms