Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms