Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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LAPTM4AQ15012 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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LAPTM4AQ15012 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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