Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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