Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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COL4A6Q14031 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL4A6Q14031 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL4A6Q14031 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL4A6Q14031 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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