Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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