Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms