Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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