Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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