Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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